深圳上线全国首个结核菌全基因数据库及分析平台

 
来源:中国青年报·中青在线    作者:刘芳

       中青在线深圳8月8日电  8日上午,全国首个结核菌全基因组数据库及分析平台在深圳上线,此举将显著提高结核公共卫生事件的应对水平和处置能力,避免出现下一个“桃江事件”。2017年年底,湖南桃江学校结核病公共卫生事件引起了业内外人士的高度重视。

        据介绍,该平台开展结核病突发疫情的应急检测,从基因水平鉴定不同感染者菌株之间的同源性,可以协助公共卫生工作者采取及时有效的防控措施。结核病如果出现疫情爆发,就需要启动类似SARS爆发期间的疾病控制应急机制。疾病应急控制机制的启动必然对生产和生活产生严重的不利影响。那么怎么确定疫情是否爆发呢?医疗卫生机构如何界定是否应该启动疾病控制的应急机制呢?目前定义为同一稳定群体如学校,半年内发现10例以上的结核病患者,通过基因分型应急监测,结核菌基因型相同,则定义为结核病爆发,需要采取局部应急防控措施。

       结核菌基因水平的同源性分析,有助于判定结核菌传播路径。如果两位患者体内的结核菌基因序列完全一样或者基本一样,那么这两位患者相互传染的可能性就极大,否则两者的疾病与相互之间的传播并无关系。

      由于结核菌的慢生长特性,常规耐药检测通常需要一个月以上才有结果,且之前一直没有良好的耐药检测方法。该平台只需要将数据上传到软件中,经过13个小时就可以快速全面获得结核菌的耐药信息。利用全基因组分析或基因型分析,可以掌握不同患者之间的基因型或者全基因组信息,从而判定结核菌的传播规律,为结核病预防控制提供切实有效的建议。